Папугай Kākāpō: геномнае секвеніраванне прыносіць карысць праграме захавання

Папугай Kākāpō (таксама вядомы як «сава папугай” з-за падобных на саву рысаў твару) з’яўляецца відам папугаяў, які знаходзіцца пад крытычнай пагрозай знікнення. Новая Зеландыя. Гэта незвычайная жывёла, бо яна самая доўгажывучая птушка ў свеце (дажывае да 90 гадоў). Вагой каля 3-4 кг, гэта таксама самы цяжкі папугай, які не лятае і вядзе начны лад жыцця. свет.  

Какапо насялялі Новую Зеландыю з моманту іх эвалюцыі ў ізаляцыя але іх насельніцтва хутка заняпала. У 1970-я гады было вядома аб існаванні толькі 18 мужчынскіх какапо. Існаванне самак Какапо было пацверджана ў 1980 годзе. Дзякуючы інтэнсіўнаму кіраванню захаваннем папугаі Какапо былі выведзены з мяжы знікнення. У 51 годзе іх налічвалася 1995. Сёння жывыя 247 какапо^1,2.  

Каб дапамагчы захаванню, у 125 годзе быў запушчаны праект Kākāpō2015+ для секвеніравання геномаў 125 жывых какапо плюс некаторых важных нядаўна памерлых асобін. Ідэя заключалася ў паляпшэнні генетычнага кіравання какапо, у прыватнасці, для ліквідацыі нізкай рэпрадуктыўнай здольнасці (бясплоддзя) і хвароб, якія перашкаджаюць аднаўленню. Поўная зборка эталоннага геному асобнага какапо на ўзроўні храмасом была завершана ў 2018 годзе³.  

У даследаванні, апублікаваным 29^th У жніўні 2023 г. даследчая група паведаміла аб секвенировании геномаў амаль усёй папуляцыі какапо (па стане на 2018 г.) з 169 какапо з 125 жывых асобін і 44 захаваных узораў. Даныя на ўзроўні папуляцыі звязваюць генетычную разнастайнасць відаў з пэўнымі паслядоўнасцямі ДНК, звязанымі з такімі прыкметамі, як успрымальнасць да хвароб, рост куранят і г. д. Гэта можа дапамагчы раней вызначыць рызыкі для здароўя, каб спланаваць лячэнне, адаптаванае да асобнай птушкі какапо. Гэты падыход да вызначэння спецыфічных генетычных асаблівасцей, важных для выжывання, можа быць перапрафіляваны для кіравання захаваннем іншых якія знаходзяцца пад пагрозай знікнення выгляд^4,5.  

*** 

Спасылкі:  

1. Дэпартамент аховы. Урад Новай Зеландыі. Аднаўленне Какапо. Даступны па адрасе  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Музей натуральнай гісторыі. Мудрагелісты какапо Новай Зеландыі апынуўся на мяжы знікнення. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Дэпартамент аховы. Урад Новай Зеландыі. Секвеніраванне гена Kākāpō125+ https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Універсітэт Атага, 2023 г. Навіны – Выратаванне відаў ад знікнення – высакаякаснае секвеніраванне папуляцыі kākāpō забяспечвае прарыў у разуменні ключавой генетыкі захавання. Даступны па адрасе https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Доступ 29 жніўня 2023 г.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. і інш. Агульнавідавая геноміка kākāpō дае інструменты для паскарэння выздараўлення. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Прэпрынт на bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***