SARS-CoV-2: наколькі сур'ёзны варыянт B.1.1.529, які цяпер называецца Omicron

Варыянт B.1.1.529 быў упершыню паведамлены СААЗ з Паўднёвай Афрыкі 24^th Лістапад 2021 г. Першая вядомая пацверджаная інфекцыя B.1.1.529 была атрымана з пробы, сабранай 9^th лістапада 2021¹. Іншая крыніца² паказвае, што гэты варыянт упершыню быў выяўлены ў пробах, сабраных 11^th лістапада 2021 г. у Батсване і 14^th Лістапад 2021 года ў Паўднёвай Афрыцы. З тых часоў колькасць выпадкаў COVID-19 рэзка ўзрасла амаль ва ўсіх правінцыях Паўднёвай Афрыкі. Як і 27^th У лістападзе 2021 года новыя выпадкі гэтага варыянту таксама былі зарэгістраваныя ў Бельгіі, Ганконгу, Ізраілі, Вялікабрытаніі³, Германіі, Італіі і Чэхіі, якія звязаны з падарожжамі па паходжанні.  

Дзякуй уладам Паўднёвай Афрыкі за тое, што яны не знайшлі часу на зносіны і абмен адпаведнай інфармацыяй з сусветнай навуковай супольнасцю, каб група экспертаў СААЗ магла сустрэцца 26^th лістапада 2021 г. і хутка пазначыць гэты варыянт як Варыянт, які выклікае занепакоенасць (VOC). Сур'ёзнасць справы можна было меркаваць па тым, што B.1.1.529 быў прызначаны варыянтам маніторынгу (VUM) толькі два дні таму, 24^th Лістапада 2021 г., перш чым 26-га года ён быў прызнаны ЛОС^th Лістапад 2021 г. без прызначэння першым у якасці расследуемага варыянту (VOI).  

Табліца: Варыянты SARS-CoV-2, якія выклікаюць занепакоенасць (VOC) на 26 лістапада 2021 г. 

Тэрміноўка прызначэння B.1.1.529 у якасці варыянту, які выклікае занепакоенасць (VOC), была апраўданай, таму што было выяўлена, што гэты варыянт з'яўляецца найбольш розным варыянтам SARS-CoV-2 на сённяшні дзень. У параўнанні з вірусам SARS-CoV-2, першапачаткова выяўленым у кітайскім Ухані, ён мае цэлых 30 змен амінакіслот, 3 невялікія дэлецыі і 1 невялікую ўстаўку ў бялок шыпа. З гэтых змяненняў 15 размешчаны ў дамене, які злучае рэцэптар (RBD), той частцы віруса, якая дазваляе яму пранікаць у клеткі чалавека, што прыводзіць да інфекцыі. Гэты варыянт таксама мае шэраг змяненняў і выдаленняў у іншых геномных рэгіёнах². Мутацыі настолькі шырокія, што яго можна было б назваць новым штамам, а не варыянтам. Неверагодна вялікая колькасць спайковых мутацый азначае павышаную магчымасць уцёкаў ад вядомых антыцелаў, што робіць гэты варыянт сур'ёзнай заклапочанасцю⁵.  

Пераход на новыя варыянты з'яўляецца агульным для каранавірусаў. Каранавірусы заўсёды падвяргаюцца мутацыі ў сваім геноме з надзвычай высокай хуткасцю з-за адсутнасці карэктурнай нуклеазнай актыўнасці іх палімераз; больш перадача, больш памылак рэплікацыі і, такім чынам, больш мутацый назапашваецца ў геноме, што прыводзіць да новых варыянтаў. У найноўшай гісторыі чалавечыя каранавірусы нарошчвалі мутацыі, каб стварыць новыя варыянты. З 1966 года, калі быў запісаны першы эпізод, існавала некалькі варыянтаў эпідэмій⁶. Але чаму такая шырокая мутацыя ў адным парыве? Магчыма, таму што варыянт B.1.1.529 развіўся падчас хранічнай інфекцыі чалавека з аслабленым імунітэтам, магчыма, пацыента з ВІЧ/СНІДам без лячэння⁷.  

Незалежна ад таго, што можа быць прычынай шырокіх мутацый, калі хуткасць яго распаўсюджвання ў Паўднёвай Афрыцы сведчыць пра тое, што эвалюцыя гэтага варыянту можа мець велізарнае значэнне для імунітэту, пераноснасці і вірулентнасці і эфектыўнасці існуючых вакцын, якія выкарыстоўваюцца ў цяперашні час.  

Ці будуць існуючыя вакцыны застануцца эфектыўнымі супраць гэтага новага варыянту, ці будзе больш выпадкаў прарыву вакцыны інфекцый, у цяперашні час існуе мала дадзеных, каб зрабіць нейкія высновы. Аднак у нядаўнім даследаванні сінтэтычны варыянт з 20 мутацыямі ў бялку шыпоў прадэманстраваў амаль поўны пазбяганне антыцелаў.⁷. Гэта сведчыць аб тым, што новы варыянт B.1.1.529 з значна большай колькасцю мутацый можа паказваць значна зніжаную нейтралізацыю антыцеламі. Новы варыянт, аднак, здаецца, больш трансмісіўны дзякуючы хуткай хуткасці, з якой ён замяніў варыянт Delta ў Паўднёвай Афрыцы, хоць цяперашніх дадзеных недастаткова, каб зрабіць якую-небудзь надзейную ацэнку. Сапраўды гэтак жа немагчыма каментаваць цяжар сімптомаў на гэтай стадыі.  

У сувязі з тым, што Еўропа ўжо хвалюецца з незвычайна вялікай колькасцю выпадкаў COVID-19 (з-за дэльта-варыянта з высокай перадачай) за апошнія некалькі тыдняў і хуткай хуткасці, з якой Омикрон (B.1.1.529) варыянт распаўсюдзіўся ў Паўднёвай Афрыцы, які нядаўна замяніў варыянт дэльта, некалькі краін Еўропы, уключаючы Вялікабрытанію, Германію і Італію, увялі абмежаванні на паездкі на прыбыцця з Паўднёвай Афрыкі і з суседніх краін, такіх як Батсвана, Малаві, Мазамбік, Замбія і Ангола. Асцерагаючыся горшага, Ізраіль павінен забараніць уезд гасцей з усіх краін.  

Свет інвеставаў так шмат у распрацоўку і ўвядзенне вакцын супраць COVID-19, каб абараніць людзей ад пандэміі. Пытанне, якое ўваходзіць у галаву як навукоўцам, так і ўладам, - ці застануцца эфектыўнымі і супраць варыянту Omicron (B.19) асноўныя вакцыны супраць COVID-1.1.529, такія як Pfizer-BioNTech, Oxford-AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson . Гэтаму спрыяе той факт, што ў Паўднёвай Афрыцы былі зарэгістраваныя прарыўныя інфекцыі. Два выпадкі ў Ганконгу таксама атрымалі дозы вакцыны⁹. 

Распрацоўка «панкаранавірусных» вакцын¹⁰ (платформы шматвалентных вакцын¹¹), здаецца, неабходнасць гадзіны. Але больш хутка, магчыма, атрымаецца хутка вырабіць бустерные дозы мРНК і ДНК-вакцын, якія ахопліваюць мутацыі. Акрамя таго, нядаўна зацверджаны супрацьвірусныя (Merck's Molnupiravir і Pfizer's Paxlovid) павінны быць карыснымі для абароны людзей ад шпіталізацыі і смерці.   

 *** 

Спасылкі:  

1. СААЗ 2021. Навіны – Класіфікацыя Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Варыянт, які выклікае занепакоенасць. Апублікавана 26 лістапада 2021 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Еўрапейскі цэнтр па прафілактыцы і кантролі захворванняў. Наступствы з'яўлення і распаўсюджвання SARSCoV-2 B.1.1. 529 варыянт заклапочанасці (Omicron), для ЕС/ЕЭЗ. 26 лістапада 2021 г. ECDC: Стакгольм; 2021. Даступны ў Інтэрнэце па адрасе https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Урад Вялікабрытаніі 2021 г. Прэс-рэліз – у Вялікабрытаніі выяўлены першыя выпадкі заражэння варыянтам Omicron. Апублікавана 27 лістапада 2021 г. Даступна па адрасе https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. СААЗ, 2021. Адсочванне варыянтаў SARS-CoV-2. Даступны ў Інтэрнэце па адрасе https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Томас Паўлін: нашчадак B.1.1, звязаны з Паўднёвай Афрыкай з вялікай колькасцю мутацый Спайка №343. Даступны ў Інтэрнэце па адрасе https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Прасад U.2021. Варыянты каранавіруса: што мы ведаем да гэтага часу. Навуковая еўрапейская. Апублікавана 12 ліпеня 2021 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Праца вакцыны – Што мы ведаем пра новы варыянт коронавіруса B.1.1.529 і ці варта турбавацца? Даступны па адрасе https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Шміт Ф., Вайсблюм Ю., Руткоўская М. і інш. Высокі генетычны бар'ер для ўцёкаў поліклональных нейтралізуючых антыцелаў SARS-CoV-2. Прырода (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Моцна мутаваны варыянт коронавіруса ставіць навукоўцаў у гатоўнасць. Прырода News. Абноўлена 27 лістапада 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Соні Р. 2021. Вакцыны «Пан-каранавірус»: РНК-палімераза становіцца мішэнню для вакцыны. Навуковая еўрапейская. Апублікавана 16 лістапада 2021 г. Даступна па адрасе http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Рэліз навін - NIAID выдае новыя ўзнагароды для фінансавання «панкаранавірусных» вакцын. Апублікавана 28 верасня 2021 г. Даступна па адрасе https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***