РЭКЛЯМА

Дыягнастычныя тэсты на COVID-19: ацэнка сучасных метадаў, практыкі і будучыні

Лабараторныя тэсты для дыягностыкі COVID-19, якія зараз праводзяцца на практыцы ў адпаведнасці з рэкамендацыямі міжнародных экспертных груп, разглядаюцца і ацэньваюцца.

COVID-19 хвароба, якая ўзнікла ў кітайскім горадзе Ухань, да гэтага часу закранула больш чым 208 краін. За апошнія некалькі месяцаў навуковая супольнасць ва ўсім свеце была пастаўлена перад сур'ёзнай праблемай - развівацца дыягнастычныя тэсты для Covid-19 выяўленне захворвання з мэтай абследавання пацыентаў і падазраваных асоб з мэтай эфектыўнага кіравання і кантролю над пандэміяй.

Перш чым ацаніць сучасныя метады і практыкі, якія выкарыстоўваюцца для выяўлення COVID-19, давайце спачатку зразумець, што выклікае COVID-19 і як распрацаваць дыягнастычныя тэсты для абследавання пацыентаў на гэта захворванне. Захворванне COVID-19 выклікаецца станоўча ланцуговай РНК вірус якія з'яўляюцца зоонозами, што азначае, што яны могуць перасякаць відавыя бар'еры ад жывёл да чалавека і могуць выклікаць у людзей хваробы ад звычайнай прастуды да больш цяжкіх захворванняў, такіх як MERS і ВРВІ. Міжнародны камітэт таксаноміі вірусаў (ICTV) назваў вірус, які выклікае COVID-19, зараз названы SARS-CoV-2, паколькі ён вельмі падобны на той, які выклікаў успышку ВРВІ (SARS-CoVs). Дыягнастычны тэст на захворванне COVID-19 можна распрацаваць рознымі спосабамі.

Самым папулярным і прынятым ва ўсім свеце метадам з'яўляецца распрацоўка дыягнастычнага тэсту, які можа выяўляць сам вірус SARS-CoV-2. гэта тэст заснаваны на выяўленні віруснага геному ва ўзоры пацыента з дапамогай ПЦР у рэжыме рэальнага часу RT (палімеразная ланцуговая рэакцыя з зваротнай транскриптазой ў рэальным часе). Гэта цягне за сабой пераўтварэнне віруснай РНК у ДНК з дапамогай фермента, званага зваротнай транскриптазы, а затым узмацненне ДНК з дапамогай пэўнага набору праймераў і флуоресцентного зонда, якія звязваюцца з пэўнай вобласцю на віруснай ДНК, з дапамогай Taq-палімеразы і выяўлення флуоресцентного сігналу. Гэтыя тэсты называюць NAATs (Тэсты на ўзмацненне нуклеінавых кіслот). Гэтая методыка можа быць вельмі карыснай для вельмі ранняга выяўлення прысутнасці нуклеінавай кіслаты ва ўзоры пацыента, нават у бессімптомных пацыентаў, якія не праяўляюць сімптомаў захворвання COVID-19 (асабліва ў інкубацыйны перыяд 14-28 дзён) і ў больш позняй частцы а таксама, калі хвароба паўнавартасна.

Розныя кампаніі па ўсім свеце працавалі ў гонцы з часам на працягу апошніх некалькіх месяцаў, каб распрацаваць дыягнастычны тэст на аснове NAAT для выяўлення SARS-CoV-2 на аснове CDC (Цэнтр па кантролі захворванняў), Атланты, ЗША і рэкамендацый СААЗ ( 1, 2). Улады аховы здароўя ва ўсім свеце ўхваляюць гэтыя тэсты для экстранага выкарыстання для выяўлення SARS-CoV-2. Вірусныя гены, на якія арыентаваліся да гэтага часу, уключаюць гены N, E, S і RdRP, а таксама адпаведныя станоўчыя і адмоўныя кантрольныя групы. Ўзоры пацыента, якія адбіраюцца для такога аналізу, бяруцца з верхніх дыхальных шляхоў (насаглотка і ротоглотка) і / або ніжніх дыхальных шляхоў (мокрота і / або эндотрахеальный аспират або бронхоальвеолярный лаваж). Аднак таксама можна выявіць вірус у іншых узорах, у тым ліку ў крэсле і крыві. Узоры неабходна хутка адбіраць адпаведным чынам, прымаючы ўсе неабходныя меры засцярогі і прытрымліваючыся практыкі біябяспекі (у адпаведнасці з рэкамендацыямі СААЗ[1]), у пацыентаў, якія адпавядаюць вызначэнні падазраванага захворвання на COVID-19, захоўваючы і ўпакоўваючы іх добра, калі яго неабходна даставіць у дыягнастычны цэнтр, а затым апрацаваць (здабыванне РНК у шафе для біялагічнай бяспекі ў BSL-2 або эквівалентнай установе) такім чынам, каб забяспечыць цэласнасць ўзору. Усё гэта павінна выконвацца ў першачарговым парадку для лепшага клінічнага кіравання і кантролю ўспышкі.

Час выяўлення для розных даступных тэстаў на аснове NAAT, распрацаваных буйнымі дыягнастычнымі кампаніямі па ўсім свеце, вар'іруецца ад 45 хвілін да 3.5 гадзін. У гэтыя тэсты ўносяцца розныя паляпшэнні, каб пераўтварыць іх у тэсты па догляду і дасягнуць жаданых вынікаў за як мага меншы час без шкоды для дакладнасці выніку, каб павялічыць колькасць тэстаў, якія можна зрабіць за дзень.

Іншыя варыянты дыягнастычнага тэсту экспрэс-дыягнастычныя тэсты (РДТ) якія альбо выяўляюць вірусныя антыгены/вавёркі, якія экспрэсаваныя на паверхні часціц віруса SARS-CoV-2, калі яны размнажаюцца ў клетках гаспадара і выклікаюць захворванне, альбо антыцелы гаспадара ў адказ на інфекцыю; гэты тэст выяўляе наяўнасць антыцелаў у крыві людзей, якія, як мяркуецца, былі заражаныя COVID-19 (3).

Дакладнасць і ўзнаўляльнасць RDT для выяўлення вірусных антыгенаў залежыць ад некалькіх фактараў, уключаючы час ад пачатку захворвання, канцэнтрацыю віруса ў ўзоры, якасць і апрацоўку ўзору, а таксама склад рэагентаў, якія прысутнічаюць у наборах для тэставання. З-за гэтых зменных, адчувальнасць гэтых тэстаў можа вар'іравацца ад 34% да 80%. Асноўным недахопам гэтага варыянту з'яўляецца тое, што вірус павінен знаходзіцца ў стадыі рэплікацыі і інфекцыі, каб выявіць вірусныя вавёркі.

Аналагічным чынам тэсты, якія выяўляюць антыцелы гаспадара, заснаваныя на сіле рэакцыі антыцелаў, якая залежыць ад такіх фактараў, як узрост, стан харчавання, цяжар захворвання і некаторыя лекі або інфекцыі, якія душаць імунную сістэму. Асноўным недахопам гэтага варыянту з'яўляецца тое, што антыцелы выпрацоўваюцца на працягу некалькіх дзён да тыдняў пасля заражэння вірусам SARS-CoV-2, і трэба чакаць столькі часу, каб правесці тэст. Гэта азначае, што дыягназ інфекцыі COVID-19 на аснове адказу антыцелаў гаспадара часта будзе магчымы толькі на этапе выздараўлення, калі многія магчымасці для клінічнага ўмяшання або прадухілення перадачы захворвання ўжо прайшлі.

У цяперашні час згаданыя вышэй RDT былі зацверджаны толькі ў даследчых умовах, а не для клінічнай дыягностыкі з-за адсутнасці дадзеных (3, 4). Па меры паступлення ўсё больш і больш эпідэміялагічных даных па COVID-19 будзе распрацавана і зацверджана ўсё больш RDTs у якасці абследавання ў клінічных умовах, паколькі яны могуць даць вынікі праз 10-30 хвілін у адрозненне ад тэстаў на аснове NAAT, якія ў сярэднім займаюць некалькі гадзін для выяўлення хваробы.

***

Спасылкі:
1. СААЗ, 2020 г. Рэкамендацыі па стратэгіі лабараторных тэсціравання на COVID-19. Прамежкавае кіраўніцтва. 21 сакавіка 2020 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331509/WHO-COVID-19-lab_testing-2020.1-eng.pdf Доступ 09 красавіка 2020 г
2. CDC 2020. Інфармацыя для лабараторый. Прамежкавае кіраўніцтва для лабараторый Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html Доступ 09 красавіка 2020 г.
3. СААЗ, 2020 г. Парады па выкарыстанні тэстаў у пунктах медыцынскай дапамогі. Навуковая справаздача. 08 красавіка 2020 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19 Доступ 09 красавіка 2020 г.
4. ECDC, 2020. Агляд сітуацыі з экспрэс-тэстамі для дыягностыкі COVID-19 у ЕС/ЕЭЗ. 01 красавіка 2020 г. Еўрапейскі цэнтр прафілактыкі і кантролю захворванняў. Даступны ў Інтэрнэце па адрасе https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/overview-rapid-test-situation-covid-19-diagnosis-eueea Доступ 09 красавіка 2020 г

***

Раджыў Соні
Раджыў Соніhttps://web.archive.org/web/20220523060124/https://www.rajeevsoni.org/publications/
Доктар Раджыў Соні (ORCID ID : 0000-0001-7126-5864) мае ступень доктара філасофіі. у біятэхналогіі з Кембрыджскага ўніверсітэта, Вялікабрытанія і мае 25-гадовы досвед працы па ўсім свеце ў розных інстытутах і транснацыянальных кампаніях, такіх як Навукова-даследчы інстытут Scripps, Novartis, Novozymes, Ranbaxy, Biocon, Biomerieux, а таксама ў якасці галоўнага даследчыка ў ваенна-марской даследчай лабараторыі ЗША у адкрыцці лекаў, малекулярнай дыягностыцы, экспрэсіі бялку, вытворчасці біялагічных прэпаратаў і развіцці бізнесу.

Падпішыцеся на нашу рассылку

Каб быць у курсе ўсіх апошніх навін, прапаноў і спецыяльных аб'яў.

Самыя папулярныя артыкулы

Гравітацыйныя хвалі над небам Антарктыды

Паходжанне таямнічай рабізы, якую называюць гравітацыйнымі хвалямі...

Да рашэння на аснове глебы для змены клімату 

Новае даследаванне вывучала ўзаемадзеянне паміж біямалекуламі і глінай...
- Рэклама -
92,791Вентылятарыяк
47,295паслядоўнікіпрытрымлівацца
1,772паслядоўнікіпрытрымлівацца
30падпісчыкіпадпісвацца