Лабараторныя тэсты для дыягностыкі COVID-19, якія зараз праводзяцца на практыцы ў адпаведнасці з рэкамендацыямі міжнародных экспертных груп, разглядаюцца і ацэньваюцца.
COVID-19 хвароба, якая ўзнікла ў кітайскім горадзе Ухань, да гэтага часу закранула больш чым 208 краін. За апошнія некалькі месяцаў навуковая супольнасць ва ўсім свеце была пастаўлена перад сур'ёзнай праблемай - развівацца дыягнастычныя тэсты для Covid-19 выяўленне захворвання з мэтай абследавання пацыентаў і падазраваных асоб з мэтай эфектыўнага кіравання і кантролю над пандэміяй.
Перш чым ацаніць сучасныя метады і практыкі, якія выкарыстоўваюцца для выяўлення COVID-19, давайце спачатку зразумець, што выклікае COVID-19 і як распрацаваць дыягнастычныя тэсты для абследавання пацыентаў на гэта захворванне. Захворванне COVID-19 выклікаецца станоўча ланцуговай РНК вірус якія з'яўляюцца зоонозами, што азначае, што яны могуць перасякаць відавыя бар'еры ад жывёл да чалавека і могуць выклікаць у людзей хваробы ад звычайнай прастуды да больш цяжкіх захворванняў, такіх як MERS і ВРВІ. Міжнародны камітэт таксаноміі вірусаў (ICTV) назваў вірус, які выклікае COVID-19, зараз названы SARS-CoV-2, паколькі ён вельмі падобны на той, які выклікаў успышку ВРВІ (SARS-CoVs). Дыягнастычны тэст на захворванне COVID-19 можна распрацаваць рознымі спосабамі.
Самым папулярным і прынятым ва ўсім свеце метадам з'яўляецца распрацоўка дыягнастычнага тэсту, які можа выяўляць сам вірус SARS-CoV-2. гэта тэст заснаваны на выяўленні віруснага геному ва ўзоры пацыента з дапамогай ПЦР у рэжыме рэальнага часу RT (палімеразная ланцуговая рэакцыя з зваротнай транскриптазой ў рэальным часе). Гэта цягне за сабой пераўтварэнне віруснай РНК у ДНК з дапамогай фермента, званага зваротнай транскриптазы, а затым узмацненне ДНК з дапамогай пэўнага набору праймераў і флуоресцентного зонда, якія звязваюцца з пэўнай вобласцю на віруснай ДНК, з дапамогай Taq-палімеразы і выяўлення флуоресцентного сігналу. Гэтыя тэсты называюць NAATs (Тэсты на ўзмацненне нуклеінавых кіслот). Гэтая методыка можа быць вельмі карыснай для вельмі ранняга выяўлення прысутнасці нуклеінавай кіслаты ва ўзоры пацыента, нават у бессімптомных пацыентаў, якія не праяўляюць сімптомаў захворвання COVID-19 (асабліва ў інкубацыйны перыяд 14-28 дзён) і ў больш позняй частцы а таксама, калі хвароба паўнавартасна.
Розныя кампаніі па ўсім свеце працавалі ў гонцы з часам на працягу апошніх некалькіх месяцаў, каб распрацаваць дыягнастычны тэст на аснове NAAT для выяўлення SARS-CoV-2 на аснове CDC (Цэнтр па кантролі захворванняў), Атланты, ЗША і рэкамендацый СААЗ ( 1, 2). Улады аховы здароўя ва ўсім свеце ўхваляюць гэтыя тэсты для экстранага выкарыстання для выяўлення SARS-CoV-2. Вірусныя гены, на якія арыентаваліся да гэтага часу, уключаюць гены N, E, S і RdRP, а таксама адпаведныя станоўчыя і адмоўныя кантрольныя групы. Ўзоры пацыента, якія адбіраюцца для такога аналізу, бяруцца з верхніх дыхальных шляхоў (насаглотка і ротоглотка) і / або ніжніх дыхальных шляхоў (мокрота і / або эндотрахеальный аспират або бронхоальвеолярный лаваж). Аднак таксама можна выявіць вірус у іншых узорах, у тым ліку ў крэсле і крыві. Узоры неабходна хутка адбіраць адпаведным чынам, прымаючы ўсе неабходныя меры засцярогі і прытрымліваючыся практыкі біябяспекі (у адпаведнасці з рэкамендацыямі СААЗ[1]), у пацыентаў, якія адпавядаюць вызначэнні падазраванага захворвання на COVID-19, захоўваючы і ўпакоўваючы іх добра, калі яго неабходна даставіць у дыягнастычны цэнтр, а затым апрацаваць (здабыванне РНК у шафе для біялагічнай бяспекі ў BSL-2 або эквівалентнай установе) такім чынам, каб забяспечыць цэласнасць ўзору. Усё гэта павінна выконвацца ў першачарговым парадку для лепшага клінічнага кіравання і кантролю ўспышкі.
Час выяўлення для розных даступных тэстаў на аснове NAAT, распрацаваных буйнымі дыягнастычнымі кампаніямі па ўсім свеце, вар'іруецца ад 45 хвілін да 3.5 гадзін. У гэтыя тэсты ўносяцца розныя паляпшэнні, каб пераўтварыць іх у тэсты па догляду і дасягнуць жаданых вынікаў за як мага меншы час без шкоды для дакладнасці выніку, каб павялічыць колькасць тэстаў, якія можна зрабіць за дзень.
Іншыя варыянты дыягнастычнага тэсту экспрэс-дыягнастычныя тэсты (РДТ) якія альбо выяўляюць вірусныя антыгены/вавёркі, якія экспрэсаваныя на паверхні часціц віруса SARS-CoV-2, калі яны размнажаюцца ў клетках гаспадара і выклікаюць захворванне, альбо антыцелы гаспадара ў адказ на інфекцыю; гэты тэст выяўляе наяўнасць антыцелаў у крыві людзей, якія, як мяркуецца, былі заражаныя COVID-19 (3).
Дакладнасць і ўзнаўляльнасць RDT для выяўлення вірусных антыгенаў залежыць ад некалькіх фактараў, уключаючы час ад пачатку захворвання, канцэнтрацыю віруса ў ўзоры, якасць і апрацоўку ўзору, а таксама склад рэагентаў, якія прысутнічаюць у наборах для тэставання. З-за гэтых зменных, адчувальнасць гэтых тэстаў можа вар'іравацца ад 34% да 80%. Асноўным недахопам гэтага варыянту з'яўляецца тое, што вірус павінен знаходзіцца ў стадыі рэплікацыі і інфекцыі, каб выявіць вірусныя вавёркі.
Аналагічным чынам тэсты, якія выяўляюць антыцелы гаспадара, заснаваныя на сіле рэакцыі антыцелаў, якая залежыць ад такіх фактараў, як узрост, стан харчавання, цяжар захворвання і некаторыя лекі або інфекцыі, якія душаць імунную сістэму. Асноўным недахопам гэтага варыянту з'яўляецца тое, што антыцелы выпрацоўваюцца на працягу некалькіх дзён да тыдняў пасля заражэння вірусам SARS-CoV-2, і трэба чакаць столькі часу, каб правесці тэст. Гэта азначае, што дыягназ інфекцыі COVID-19 на аснове адказу антыцелаў гаспадара часта будзе магчымы толькі на этапе выздараўлення, калі многія магчымасці для клінічнага ўмяшання або прадухілення перадачы захворвання ўжо прайшлі.
У цяперашні час згаданыя вышэй RDT былі зацверджаны толькі ў даследчых умовах, а не для клінічнай дыягностыкі з-за адсутнасці дадзеных (3, 4). Па меры паступлення ўсё больш і больш эпідэміялагічных даных па COVID-19 будзе распрацавана і зацверджана ўсё больш RDTs у якасці абследавання ў клінічных умовах, паколькі яны могуць даць вынікі праз 10-30 хвілін у адрозненне ад тэстаў на аснове NAAT, якія ў сярэднім займаюць некалькі гадзін для выяўлення хваробы.
***
Спасылкі:
1. СААЗ, 2020 г. Рэкамендацыі па стратэгіі лабараторных тэсціравання на COVID-19. Прамежкавае кіраўніцтва. 21 сакавіка 2020 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331509/WHO-COVID-19-lab_testing-2020.1-eng.pdf Доступ 09 красавіка 2020 г
2. CDC 2020. Інфармацыя для лабараторый. Прамежкавае кіраўніцтва для лабараторый Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html Доступ 09 красавіка 2020 г.
3. СААЗ, 2020 г. Парады па выкарыстанні тэстаў у пунктах медыцынскай дапамогі. Навуковая справаздача. 08 красавіка 2020 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19 Доступ 09 красавіка 2020 г.
4. ECDC, 2020. Агляд сітуацыі з экспрэс-тэстамі для дыягностыкі COVID-19 у ЕС/ЕЭЗ. 01 красавіка 2020 г. Еўрапейскі цэнтр прафілактыкі і кантролю захворванняў. Даступны ў Інтэрнэце па адрасе https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/overview-rapid-test-situation-covid-19-diagnosis-eueea Доступ 09 красавіка 2020 г
***
