B.1.617 Варыянт SARS COV-2: Вірулентнасць і наступствы для вакцын

Варыянт B.1.617, які выклікаў нядаўні крызіс COVID-19 у Індыі, быў датычны да павелічэння перадачы захворвання сярод насельніцтва і стварае значныя праблемы ў дачыненні да цяжару захворвання і эфектыўнасці даступных у цяперашні час вакцын. 

COVID-19 нанёс беспрэцэдэнтны ўрон ва ўсім свеце як у сацыяльным, так і ў эканамічным плане. Некаторыя краіны таксама былі сведкамі другой і трэцяй хваль. У апошні час у Індыі павялічылася колькасць выпадкаў, у якіх у сярэднім за апошні месяц назіралася ад трох да чатырохсот тысяч выпадкаў кожны дзень. Нядаўна мы прааналізавалі, што, магчыма, пайшло не так з крызісам COVID у Індыі¹. Акрамя сацыяльных і культурных фактараў, якія маглі прывесці да ўздыму, сам вірус мутаваў такім чынам, што прывяло да з'яўлення варыянту, больш заразнага, чым раней. У гэтым артыкуле апісваецца тое, як мог з'явіцца новы варыянт, яго патэнцыял, які можа выклікаць хваробу, і наступствы для эфектыўнасці вакцыны, а таксама пра тое, якія крокі можна распачаць, каб паменшыць яе ўплыў на мясцовым і глабальным узроўні і прадухіліць далейшае з'яўленне новых варыянтаў. 

В.1.617 варыянт упершыню з'явіўся ў кастрычніку 2020 года ў штаце Махараштра і з тых часоў распаўсюдзіўся прыкладна ў 40 краінах, уключаючы Злучанае Каралеўства, Фіджы і Сінгапур. За апошнія некалькі месяцаў штам стаў дамінуючым штамам па ўсёй Індыі, і асабліва ў апошнія 4-6 тыдняў быў адказным за велізарны рост заражэння. B.1.617 мае восем мутацый, з якіх 3 мутацыі, а менавіта L452R, E484Q і P681R, з'яўляюцца ключавымі. І L452R, і E484Q знаходзяцца ў дамене звязвання рэцэптараў (RBD) і адказваюць не толькі за павелічэнне звязвання з рэцэптарам ACE2² што прыводзіць да павышэння трансмісіўнасці, але таксама гуляюць ролю ў нейтралізацыі антыцелаў³. Мутацыя P681R значна ўзмацняе адукацыю синциция, што патэнцыйна спрыяе ўзмацненню патагенезу. Гэтая мутацыя прымушае вірусныя клеткі злівацца разам, ствараючы большую прастору для рэплікацыі віруса і абцяжарваючы іх знішчэнне антыцеламі. У дадатак да B.1.617, два іншыя штамы, магчыма, таксама былі адказнымі за павышэнне ўзроўню заражэння, В.1.1.7 у Дэлі і Пенджабе і B.1.618 у Заходняй Бенгаліі. Штам B.1.1.7 быў упершыню ідэнтыфікаваны ў Вялікабрытаніі ў другой палове 2020 года і нясе мутацыю N501Y у RBD, што прывяло да яго падвышанай трансмісіўнасці за кошт узмоцненага звязвання з рэцэптарам ACE2⁴. Акрамя таго, ён мае іншыя мутацыі, у тым ліку дзве дэлецыі. B.1.1.7 да гэтага часу распаўсюдзіўся па ўсім свеце і атрымаў мутацыю E484R у Вялікабрытаніі і ЗША. Было паказана, што мутант E484R мае 6-разовае зніжэнне адчувальнасці да імунных сываратак ад асоб, вакцынаваных мРНК-вакцынай Pfizer, і 11-разовае зніжэнне адчувальнасці да сываратак рэканвалесцэнтаў.⁵. 

Новы штам віруса з дадатковымі мутацыямі можа з'явіцца толькі тады, калі вірус заражае гаспадароў і падвяргаецца рэплікацыі. Гэта прыводзіць да генерацыі больш «прыстасаваных» і інфекцыйных варыянтаў. Гэтага можна было б пазбегнуць, прадухіляючы перадачу чалавека, прытрымліваючыся такіх пратаколаў бяспекі, як сацыяльнае дыстанцыяванне, адпаведнае выкарыстанне масак у грамадскіх месцах і людных месцах і элементарныя правілы асабістай гігіены. З'яўленне і распаўсюджванне B.1.617 сведчыць аб тым, што гэтыя рэкамендацыі па бяспецы, магчыма, не выконваліся строга.  

Штам B.1.617, які стварыў хаос у Індыі, быў класіфікаваны Сусветнай арганізацыяй аховы здароўя (СААЗ) як «варыянт, які выклікае занепакоенасць (ЛОС)». Гэтая класіфікацыя заснавана на падвышанай трансмісіўнасці і распаўсюджванні цяжкага захворвання па разнавіднасці.  

У даследаваннях на жывёл з выкарыстаннем хамякоў было паказана, што штам B.1.617 выклікае больш моцнае запаленне, чым любыя іншыя варыянты⁶. Акрамя таго, гэты варыянт атрымаў павышаную эфектыўнасць у клеткавых лініях in vitro і не звязваўся з бамланівімабам, антыцелам, які выкарыстоўваецца для лячэння COVID-19.⁷. Даследаванні Гупты і яго калег паказалі, што хоць нейтралізуючыя антыцелы, якія выпрацоўваюцца асобамі, прышчэпленымі з дапамогай вакцыны Pfizer, былі прыкладна на 80% менш эфектыўнымі супраць некаторых мутацый у B.1.617, гэта не зробіць вакцынацыю неэфектыўнай³. Гэтыя даследчыкі таксама выявілі, што некаторыя медыцынскія работнікі ў Дэлі, якія былі прышчэплены Covishield (вакцына Oxford-AstraZeneca), зноў заразіліся штамам B.1.617. Дадатковыя даследаванні Стэфана Польмана і яго калег⁷ выкарыстоўваючы сыроватку ад людзей, якія раней былі заражаныя SARS-CoV-2, выявілі, што іх антыцелы нейтралізуюць B.1.617 прыкладна на 50% менш эфектыўна, чым раней цыркулюючыя штамы. Пры праверцы сыроваткі ўдзельнікаў, якія рабілі два ўколы вакцыны Pfizer, высветлілася, што антыцелы былі прыкладна на 67% менш моцнымі супраць B.1.617. 

Нягледзячы на ​​тое, што вышэйпералічаныя даследаванні паказваюць, што B.1.617 мае перавагу перад іншымі штамамі віруса з пункту гледжання больш высокай трансмісіўнасці і ў пэўнай ступені ўхілення ад нейтралізуючых антыцелаў на аснове даследаванняў антыцелаў на аснове сыроваткі, рэальная сітуацыя ў арганізме можа адрознівацца з-за да велізарнай колькасці выпрацоўваемых антыцелаў, а таксама да таго, што іншыя часткі імуннай сістэмы, такія як Т-клеткі, не могуць быць закрануты мутацыямі штаму. Гэта было паказана варыянтам B.1.351, які быў звязаны з велізарным падзеннем патэнцыі нейтралізуюць антыцелаў, але даследаванні на людзях паказваюць, што вакцыны па-ранейшаму эфектыўныя ў прадухіленні цяжкіх захворванняў. Акрамя таго, даследаванні з выкарыстаннем Covaxin таксама паказалі, што гэтая вакцына працягвае быць эфектыўнай⁸, хоць было невялікае падзенне эфектыўнасці нейтралізацыі антыцелаў, якія выпрацоўваюцца вакцынай Covaxin. 

Усе прыведзеныя вышэй дадзеныя сведчаць аб тым, што неабходны дадатковыя даследаванні, каб зразумець эфектыўнасць цяперашніх вакцын і генерацыі будучых версій, заснаваных на з'яўленні новых штамаў, якія могуць спрабаваць пазбегнуць імуннай сістэмы ў сваіх інтарэсах. Тым не менш, цяперашнія вакцыны па-ранейшаму застаюцца эфектыўнымі (хоць і не на 100%), таму, каб прадухіліць цяжкія захворванні, і свет павінен імкнуцца да масавай вакцынацыі як мага раней і адначасова сачыць за новымі штамамі, каб прымаць неабходныя і як мага хутчэй прыняць адпаведныя меры. Гэта гарантуе, што жыццё можа вярнуцца да нармальнага раней, чым пазней. 

***

Спасылкі:  

1. Соні Р. 2021. Крызіс COVID-19 у Індыі: што можа пайсці не так. Навуковая еўрапейская. Апублікавана 4 мая 2021 г. Даступна ў Інтэрнэце па адрасе http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/covid-19-crisis-in-india-what-may-have-gone-wrong/ 

2. Чэрыян С і інш. 2021. Канвергентная эвалюцыя шыпавых мутацый SARS-CoV-2, L452R, E484Q і P681R, падчас другой хвалі COVID-19 у Махараштра, Індыя. Прэпрынт на bioRxiv. Апублікавана 03 мая 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.04.22.440932   

3. Ферэйра І., Датыр Р., і інш 2021. SARS-CoV-2 B.1.617 з'яўленне і адчувальнасць да антыцелаў, выкліканых вакцынай. Перадпрынт. BioRxiv. Апублікавана 09 мая 2021 г. DOI: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.08.443253v1  

4. Гупта Р. К. 2021. Ці паўплываюць варыянты заклапочанасці SARS-CoV-2 на абяцанні вакцын?. Nat Rev Immunol. Апублікавана: 29 красавіка 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1038/s41577-021-00556-5 

5. Collier DA і соавт. 2021. Адчувальнасць SARS-CoV-2 B.1.1.7 да антыцелаў, выкліканых мРНК вакцынай. Прырода https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7. 

6. Ядаў П.Д і інш. 2021. Варыянт SARS CoV-2 B.1.617.1 з'яўляецца высокапатагенным для хамякоў, чым варыянт B.1. Прэпрынт на bioRxiv. Апублікавана 05 мая 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.05.442760   

7. Гофман М і інш. 2021. Варыянт SARS-CoV-2 B.1.617 устойлівы да бамланівімабу і ўхіляецца ад антыцелаў, выкліканых інфекцыяй і вакцынацыяй. Апублікавана 05 мая 2021 г. Прэпрынт на bioRxiv. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442663   

8. Ядаў П.Д і інш. 2021 г. Нейтралізацыя даследуемага варыянту В.1.617 сыроваткамі вакцын BBV152. Апублікавана: 07 мая 2021 г. Clin. Заразіць. Дыс. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciab411   

***